Hi.
Ich nutze R für Statistikzwecke und darin das Paket playwith.
Alles läuft einwandfrei, außer ich will zum schluss die mit R und playwith generierte Grafik speichern.
Wenn ich das ganze nur in R mache, klappt es einwandfrei.
Jemand vielleicht ne Idee, was das sein könnte?
Thx
Rpy und Paket "playwith" macht probleme
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Du magst uns nicht noch ein paar Details verraten?
(RPy oder RPy2? Was ist der Code? Was ggf. ist die Fehlermeldung?)
Gruß,
Christian
(RPy oder RPy2? Was ist der Code? Was ggf. ist die Fehlermeldung?)
Gruß,
Christian
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ups, hab ich in der eile vergessen.
ich nutze:
- python 2.5.2 (wegen mysql anbindung)
- rpy 1.0.3
- R 2.7.0
values ist dabei eine liste mit float werten.
das proble ist jetzt nur, das der plot ja angezeigt, ich daran rummalen und zoomen kann. auch das ausdrucken klappt.
will ich den plot aber speichern, dann "blockiert" das playwith fenster und ich kann es nur noch abschießen und bekomm keine fehlermeldung in python.
ich nutze:
- python 2.5.2 (wegen mysql anbindung)
- rpy 1.0.3
- R 2.7.0
Code: Alles auswählen
from rpy import r
r.library("playwith")
r.assign("var", values)
#make playwith plot
r("""
playwith({
plot(var, xlab = "Daten", ylab = "Werte", pch = ".")
lines(var)
}, title = "Auswertung")
"""
)
das proble ist jetzt nur, das der plot ja angezeigt, ich daran rummalen und zoomen kann. auch das ausdrucken klappt.
will ich den plot aber speichern, dann "blockiert" das playwith fenster und ich kann es nur noch abschießen und bekomm keine fehlermeldung in python.
Hm, in der Tat. Da scheint ein Bug in playwith zu sein. (Habe nie wirklich genutzt, weshalb es mir nicht auffiel.) Immerhin, ich erhalte einen Traceback:
Vielleicht kannst Du das dem Felix Andrews (siehe http://code.google.com/p/playwith/ ) zusenden und ihn bitten das zu fixen? (Habe selbst zu viele andere Dinge um die Ohren.)
Meine Settings:
Ubuntu 9.04
Python 2.6.2
R 2.8.1
rpy 1.0.3
playwith 0.9-44 von CRAN.
Wäre schön, wenn Du hier posten könntest, wie es weiter geht.
Oder hat jemand eine andere Idee, wie der Traceback zu interpretieren ist, bzw. was zu tun ist?
Gruß,
Christian
Code: Alles auswählen
*** caught segfault ***
address 0x48, cause 'memory not mapped'
Traceback:
1: print.default("/home/cm/Desktop/test.ps")
2: print("/home/cm/Desktop/test.ps")
3: do.call(h$action, list(h$file))
4: handler(h)
5: .gfile(toolkit, text = text, type = type, initialfilename = initialfilename, filter = filter, handler = handler, action = action, ...)
6: .gfile(toolkit, text = text, type = type, initialfilename = initialfilename, filter = filter, handler = handler, action = action, ...)
7: gfile("Export plot to image file", type = "save", filter = filter, initialfilename = myDefault)
8: function (widget, playState) { playFreezeGUI(playState) on.exit(playThawGUI(playState)) myExt <- playwith.getOption("save.as.format") myDefault <- if (!is.null(playState$title)) playState$title else playState$callName myDefault <- paste(myDefault, myExt, sep = ".") okExt <- c("pdf", "png", "jpg", "jpeg", "tif", "tiff", "ps", "eps", "svg", "wmf", "emf", "fig") filter <- list(`All files` = list(patterns = c("*")), PDF = list(patterns = c("*.pdf")), `PNG (bitmap)` = list(patterns = c("*.png")), EPS = list(patterns = c("*.eps")), SVG = list(patterns = c("*.svg")), `WMF (metafile)` = list(patterns = c("*.wmf", "*.emf")), JPEG = list(patterns = c("*.jpg", "*.jpeg")), TIFF = list(patterns = c("*.tif", "*.tiff")), xfig = list(patterns = c("*.fig"))) filename <- gfile("Export plot to image file", type = "save", filter = filter, initialfilename = myDefault) if (is.na(filename)) return() ext <- tolower(get.extension(filename)) if ((ext %in% okExt) == FALSE) { filename <- paste(filename, myExt, sep = ".") ext <- myExt } playDevSet(playState) w.in <- dev.size("in")[1] h.in <- dev.size("in")[2] ps <- playState$pointsize devName <- switch(ext, pdf = "pdf", ps = , eps = "postscript", png = "Cairo_png", jpeg = , jpg = "jpeg", tiff = , tif = "tiff", svg = "Cairo_svg", wmf = , emf = "win.metafile", fig = "xfig", { gmessage.error("Unrecognised filename extension") stop("Unrecognised filename extension") }) devFun <- get(devName, mode = "function") callNm <- if (ext == "eps") "dev.copy2eps" else "dev.copy" devCall <- call(callNm, device = devFun, file = filename, width = w.in, height = h.in, pointsize = ps) if (!is.null(formals(devFun)$units)) devCall$units <- "in" eval(devCall) dev.off()}(<pointer: 0x59e81c0>, <environment>)
Possible actions:
1: abort (with core dump, if enabled)
2: normal R exit
3: exit R without saving workspace
4: exit R saving workspace
Selection:
Meine Settings:
Ubuntu 9.04
Python 2.6.2
R 2.8.1
rpy 1.0.3
playwith 0.9-44 von CRAN.
Wäre schön, wenn Du hier posten könntest, wie es weiter geht.
Oder hat jemand eine andere Idee, wie der Traceback zu interpretieren ist, bzw. was zu tun ist?
Gruß,
Christian
PS Mit numpy arrays funktioniert es überhaupt nicht.