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Code zum entzippen einbauen

Verfasst: Dienstag 4. Mai 2021, 04:47
von desljes
Hallo :)

Ich möchte mit einer csv Datei von einer online Webseite arbeiten.
Dazu habe ich mir folgende Anleitung herausgesucht:
https://bodo-schoenfeld.de/csv-daten-mi ... net-laden/

Dabei werden die Zwischenschritte der Abspeicherung der Datei, usw. übersprungen. Ich möchte ja die Daten einfach aktualisieren können.


Bei meiner Quelle handelt es sich jedoch zusätzlich noch um eine ZIP Datei.
Bestenfalls möchte ich zur Extrahierung das Modul zipfile in meinen Code einbauen. Ich habe bereits versuch das in einem Zwischenschritt zu machen und bekomme die Fehlermeldung TypeError: 'module' object is not callable, obwohl ich das Modul im Schritt davor importieren kann.

Habt ihr eine Lösung wie und wo ich das einbauen kann oder wie ich die Datei sonst extrahieren könnte?

Danke schonmal!

desljes

Re: Code zum entzippen einbauen

Verfasst: Dienstag 4. Mai 2021, 07:10
von __deets__
Bitte den konkreten Code zeigen, in den dafür notwendigen Code Tags.

Re: Code zum entzippen einbauen

Verfasst: Dienstag 4. Mai 2021, 14:27
von desljes
Der Code ist unter dem Link ersichtlich.

Vielen Dank.

Re: Code zum entzippen einbauen

Verfasst: Dienstag 4. Mai 2021, 14:31
von Sirius3
Das ist irgend ein Code aus dem Internet, der nichts mit zip-Dateien zu tun hat.
Wo ist der Code, den Du geschrieben hast und der die Fehlermeldung zeigt, die Du hier umschrieben hast?

Re: Code zum entzippen einbauen

Verfasst: Montag 10. Mai 2021, 13:55
von desljes
Der Code ist nicht wirklich relevant, ich habe da nur herumprobiert.

Hat Jemand eine Lösung, wie ich hier einen Entzipp-Code einbauen kann?
https://bodo-schoenfeld.de/csv-daten-mi ... net-laden/


Es ist eine csv Zip Datei, welche ich direkt von der online Webseite verwenden möchte.

Gruss
desljes

Re: Code zum entzippen einbauen

Verfasst: Montag 10. Mai 2021, 14:05
von sparrow
@desljes: Mit zipfile bist du auf dem richtigen Weg. Mehr kann man dazu nicht sagen, ohne deinen Code zu sehen.

Re: Code zum entzippen einbauen

Verfasst: Dienstag 11. Mai 2021, 13:18
von desljes
Nochmals die Frage lautet: Wie kann ich eine ZIP csv Datei direkt von einer Online-Webseite extrahieren.

Mein Versuch:
Ich folge exakt dieser Anleitung und kopiere die Codes in mein Jupyterlab:
https://bodo-schoenfeld.de/csv-daten-mi ... net-laden/

Zuerst importiere ich numpy, panda (as pd), matplotlib.pyplot (as plt), request, io und zipfile.

Dann:

CSV_URL = "https://www.covid19.admin.ch/api/data/2 ... es-csv.zip"

csv_data = requests.get(CSV_URL).content

Hier versuche ich den zipcode einzubauen und bekomme eine Fehlermeldung:

with zipfile (csv_data, "r") as zip:

zip.printdir()

zip.extractall()

---------------------------------------------------------------------------
TypeError Traceback (most recent call last)
<ipython-input-13-72844f47cec3> in <module>
----> 1 with zipfile (csv_data, "r") as zip:
2 zip.printdir()
3 zip.extractall()
4 df = pd.read_csv(io.StringIO(csv_data.decode("latin1")), sep=";")

TypeError: 'module' object is not callable


Danach versuche ich trotzdem die Datei zu lesen und bekomme eine Fehlermeldung:

df = pd.read_csv(io.StringIO(csv_data.decode("latin1")), sep=";")

---------------------------------------------------------------------------
ParserError Traceback (most recent call last)
<ipython-input-14-98be56f8bb14> in <module>
----> 1 df = pd.read_csv(io.StringIO(csv_data.decode("latin1")), sep=";")

~\anaconda3\lib\site-packages\pandas\io\parsers.py in read_csv(filepath_or_buffer, sep, delimiter, header, names, index_col, usecols, squeeze, prefix, mangle_dupe_cols, dtype, engine, converters, true_values, false_values, skipinitialspace, skiprows, skipfooter, nrows, na_values, keep_default_na, na_filter, verbose, skip_blank_lines, parse_dates, infer_datetime_format, keep_date_col, date_parser, dayfirst, cache_dates, iterator, chunksize, compression, thousands, decimal, lineterminator, quotechar, quoting, doublequote, escapechar, comment, encoding, dialect, error_bad_lines, warn_bad_lines, delim_whitespace, low_memory, memory_map, float_precision)
684 )
685
--> 686 return _read(filepath_or_buffer, kwds)
687
688

~\anaconda3\lib\site-packages\pandas\io\parsers.py in _read(filepath_or_buffer, kwds)
456
457 try:
--> 458 data = parser.read(nrows)
459 finally:
460 parser.close()

~\anaconda3\lib\site-packages\pandas\io\parsers.py in read(self, nrows)
1194 def read(self, nrows=None):
1195 nrows = _validate_integer("nrows", nrows)
-> 1196 ret = self._engine.read(nrows)
1197
1198 # May alter columns / col_dict

~\anaconda3\lib\site-packages\pandas\io\parsers.py in read(self, nrows)
2153 def read(self, nrows=None):
2154 try:
-> 2155 data = self._reader.read(nrows)
2156 except StopIteration:
2157 if self._first_chunk:

pandas\_libs\parsers.pyx in pandas._libs.parsers.TextReader.read()

pandas\_libs\parsers.pyx in pandas._libs.parsers.TextReader._read_low_memory()

pandas\_libs\parsers.pyx in pandas._libs.parsers.TextReader._read_rows()

pandas\_libs\parsers.pyx in pandas._libs.parsers.TextReader._tokenize_rows()

pandas\_libs\parsers.pyx in pandas._libs.parsers.raise_parser_error()

ParserError: Error tokenizing data. C error: Expected 5 fields in line 160, saw 6

Re: Code zum entzippen einbauen

Verfasst: Dienstag 11. Mai 2021, 13:31
von Sirius3
Die erste Fehlermeldung ist doch eindeutig, ein Modul kann man nicht so benutzen, als wäre es eine Klasse oder eine Funktion. Hast Du Dir die Dokumentation zum zipfile-Modul durchgelesen?

Dann hat ein ZipFile-Objekt eine open-Methode, dessen Rückgabewert Du einfach an pandas.read_csv übergeben kannst. extractall ist also unnötig, da, wie Du schriebst, ja keine Zwischenspeicherung möchtest.

Re: Code zum entzippen einbauen

Verfasst: Dienstag 11. Mai 2021, 14:16
von __blackjack__
Man muss die Daten auch noch in ein dateiähnliches Objekt verpacken. Aber das wird in der verlinkten Webseite ja auch gemacht. Wurde nur nicht übernommen.