pytables(hdf5 base) Anfängerfragen
Verfasst: Mittwoch 27. Juni 2018, 09:05
Hallo Zusammen,
ich bin gerade dabei mich in die Thematik hdf5 und pytables einzuarbeiten.
Datenstruktur hdf5:
Im root-Verzeichnis liegen Gruppen vor, welche je zwei Attribute haben.
In den Gruppenordnern liegt je eine Tabelle (erzeug mit Pandas).
Ziel:
Nun sollen die Tabellen nach den beiden Attributen gruppiert (sortiert) werden.
Im nächsten Schritt möchte ich die Tabellen die dem Attribut zugeordnet sind auswerten.
Beispiel:
Gruppe | Attr1 |Attr2
ID1 | Suppe | warm
ID2 | Suppe | kalt
ID3 | Suppe | warm
ID 1 Array aus Tablle:
Index |Temperatur
1 | 66
2 | 62
3 | 61
...
ID 2 Array aus Tablle:
Index |Temperatur
1 | 63
2 | 61
3 | 60
...
Ziel könnte soll es sein die mittleren Temperaturen der warmen Suppe zu ermitteln und diese über dem Index(Zeitverlauf) zu plotten.
Eigene Überlegung:
Alle Gruppen durchlaufen und alle vorhandenen Attribute erfassen.
Nun hab eine Liste mit allen vorhandenen Kombinationen.
Diese könnte ich nun nacheinander durchlaufen und die mathematischen Operationen durchführen.
Ist der aufgezeigte Weg der naheliegenste .... oder gibt es sinnvollere Herangehensweisen?
Viele Grüße
Inco
ich bin gerade dabei mich in die Thematik hdf5 und pytables einzuarbeiten.
Datenstruktur hdf5:
Im root-Verzeichnis liegen Gruppen vor, welche je zwei Attribute haben.
In den Gruppenordnern liegt je eine Tabelle (erzeug mit Pandas).
Ziel:
Nun sollen die Tabellen nach den beiden Attributen gruppiert (sortiert) werden.
Im nächsten Schritt möchte ich die Tabellen die dem Attribut zugeordnet sind auswerten.
Beispiel:
Gruppe | Attr1 |Attr2
ID1 | Suppe | warm
ID2 | Suppe | kalt
ID3 | Suppe | warm
ID 1 Array aus Tablle:
Index |Temperatur
1 | 66
2 | 62
3 | 61
...
ID 2 Array aus Tablle:
Index |Temperatur
1 | 63
2 | 61
3 | 60
...
Ziel könnte soll es sein die mittleren Temperaturen der warmen Suppe zu ermitteln und diese über dem Index(Zeitverlauf) zu plotten.
Eigene Überlegung:
Alle Gruppen durchlaufen und alle vorhandenen Attribute erfassen.
Code: Alles auswählen
import tables
f= tables.open_file(wkd, 'r', driver="H5FD_CORE")
list1 = []
for node in f.root._f_walk_groups():
wert1 = f.get_node_attr('/'+node._v_name, 'Attr1')
wert2 = f.get_node_attr('/'+node._v_name, 'Attr2')
combi = str(wert1) + '_' + str(wert2)
if wert1 not in list1:
list1.append(wert1)
Diese könnte ich nun nacheinander durchlaufen und die mathematischen Operationen durchführen.
Ist der aufgezeigte Weg der naheliegenste .... oder gibt es sinnvollere Herangehensweisen?
Viele Grüße
Inco