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Verfasst: Mittwoch 14. Oktober 2009, 12:26
von mit
Sorry, habe nun konkrete Fragen:
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#1.
##my ($x1, @model1) = split /\s+/, "AXDA .255 .245 .245 .255";
x1, model1 = "AXDA .255 .245 .245 .255".split()
#2.
##my @lod = map(lg($model1[$_]/$model2[$_]), (0..3));
lod = map(lambda x: [lg($model1[x]/$model2[x] ], range(0,4))
#3
#my $a = "aagcaaatccgcgataaaattgccttggggcgtataaaagg";
#$a =~ tr/acgtACGT/01230123/;
a = "aagcaaatccgcgataaaattgccttggggcgtataaaagg";
a.translate(string.maketrans('acgtACGT', '01230123')
#4.
#my $score = sum(map($lod[$_], split //,$a));
zu 1: Leider erkennt Python nicht, dass model1 ein Array sein soll. Gibt es in Python dafür eine andere schreibweise?
zu 2: Hier bin ich nicht sicher ob es so funktionieren kann, da 1 nicht funktioniert.
zu 3: Das müsste funktionieren.
zu 4: Hier weiss ich nicht wie man es umschreibt.
Verfasst: Mittwoch 14. Oktober 2009, 12:37
von Leonidas
mit hat geschrieben:zu 1: Leider erkennt Python nicht, dass model1 ein Array sein soll. Gibt es in Python dafür eine andere schreibweise?
Ab Python 3 geht:
mit hat geschrieben:zu 2: Hier bin ich nicht sicher ob es so funktionieren kann, da 1 nicht funktioniert.
Ne, kanns nicht weil Python keine Skalar-Dollarzeichen benutzt. Das solltest du inzwischen wissen.
Verfasst: Mittwoch 14. Oktober 2009, 15:54
von Defnull
Zu 1:
x1, model1 = "AXDA .255 .245 .245 .255".split(' ')
model1 = model1.split()
Zu 2: Du solltest für eine bessere Lesbarkeit eine for-schleife nehmen. Map+lambda funktioniert, ist aber eher unleserlich. Und schmeiss die Dollar-Zeichen weg
Zu 4: Was tut es denn? Ich kann kein Perl.
Verfasst: Mittwoch 14. Oktober 2009, 18:45
von problembär
mit hat geschrieben:Wie lernt man am besten Reguläre Ausdrücke gibt es ein gutes Buch oder Howtos?
2 Seiten:
1,
2.
Gruß
Verfasst: Mittwoch 14. Oktober 2009, 19:03
von cofi
http://www.regular-expressions.info/
Dort gibt es auch Buecherempfehlungen.
Verfasst: Donnerstag 15. Oktober 2009, 06:28
von mit
Danke, aber leider funktioniert der Code immer noch nicht.
Ich habe hier (
http://www.python-forum.de/viewtopic.ph ... 717#149717 ) ein neues Thema gestartet, da es wirklich nicht mehr hier hinein gehört.
Verfasst: Donnerstag 15. Oktober 2009, 11:55
von Ronnie
mit hat geschrieben:
Leider weiss ich nicht wie diesen Perl Code:
Wie würde dies in Python aussehen?
Zur Not baust du dir eben eine eigene tr-Funktion:
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>>> def translator(source, destination):
lookup = dict(zip(source, destination))
return lambda i: ''.join([lookup[c] for c in i])
>>> tr = translator("ADFadf","XYZxyz")
>>> tr('afdFAD')
'xzyZXY'
Allerdings ist es immer empfehlenswert auf erprobte eingebaute Wege zurückzugreifen.
Verfasst: Donnerstag 15. Oktober 2009, 12:23
von EyDu
Verfasst: Donnerstag 15. Oktober 2009, 12:30
von Ronnie
Danke. Die Möglichkeit wurde ja auch schon weiter oben aufgezeigt und es ist immer sinnvoll erprobte eingebaute Funktionen/Methoden zu nutzen. Eigentlich wollte ich nur zeigen, dass es nicht schwer ist die gewünschte Funktion nachzubauen.
