Spalten in Form von arrays aus Textdatei extrahieren

[Lennart]

Hallo,

ich habe eine Textdatei mit 4 Spalten, in denen Werte für physikalische Größen stehen. Ich möchte die Werte in den Spalten in Funktionen einsetzen, oder die eine Spalte mit der anderen multiplizieren etc.

Zu diesem Zweck hatte ich mir überlegt, die Spalten in Form von arrays in Python zu überführen und dort alle Berechnungen durchzuführen.

Mein Code sieht wie folgt aus:

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import numpy as np
data = np.genfromtxt(r"C:\Users\User\Desktop\praktikum\Daten\CV\X-CV-58.txt", delimiter = " ") #AppliedPotential, time, WE1current, WE1potential = data.T #the data is written into 4 arrays: applied potential, time, WE1-Current and WE1-Potential
ApplPotential, time, WE1current, WE1potential = data.T 

Und der Fehlercode:

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%run "C:\Users\User\Desktop\praktikum\Daten\CV\test1.py"

---------------------------------------------------------------------------
ValueError                                Traceback (most recent call last)
C:\Users\User\Desktop\praktikum\Daten\CV\test1.py in <module>()
     45 #     print(text)
     46 
---> 47 data = np.genfromtxt(r"C:\Users\User\Desktop\praktikum\Daten\CV\X-CV-58.txt", delimiter = " ") #AppliedPotential, time, WE1current, WE1potential = data.T #the data is written into 4 arrays: applied potential, time, WE1-Current and WE1-Potential
     48 ApplPotential, time, WE1current, WE1potential = data.T
     49 
C:\Users\User\AppData\Local\Enthought\Canopy\edm\envs\User\lib\site-packages\numpy\lib\npyio.py in genfromtxt(fname, dtype, comments, delimiter, skip_header, skip_footer, converters, missing_values, filling_values, usecols, names, excludelist, deletechars, replace_space, autostrip, case_sensitive, defaultfmt, unpack, usemask, loose, invalid_raise, max_rows, encoding)
   2029             # Raise an exception ?
   2030             if invalid_raise:
-> 2031                 raise ValueError(errmsg)
   2032             # Issue a warning ?
   2033             else:
ValueError: Some errors were detected !
    Line #2 (got 1 columns instead of 6)
    Line #3 (got 1 columns instead of 6)
    .
    .
    .

Was muss ich denn anders machen?

[Sirius3]

@Lennart: Deine Datei sieht anders aus, als Du es genfromtxt sagst. Scheinbar willst Du 4 Spalten hast aber 6 oder 1. Wie sieht denn die Datei aus?

[Lennart]

Habe einen Teil des Problems gelöst: Und zwar habe ich Spalten, die durch Leerzeichen getrennt sind. Habe statt delimeter = "", delimeter ="()". Somit bekomme ich keine Fehlermeldung, aber sonst auch nicht anderes. Sehe auch kein Array

So sehen meine Daten aus, betseht eigentlich aus über 2000 Zeilen.

https://picload.org/view/dccrdagd/unbenannt.png.html

[Sirius3]

Deine Spalten sind durch Tabs `\t` getrennt, außerdem hast Du eine Header-Zeile.

[Lennart]

Habe es jetzt geändert:

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data = np.genfromtxt(r"C:\Users\User\Desktop\praktikum\Daten\CV\X-CV-58.txt", delimiter = "\t", skip_header = 1) 
a,b,c,d = data.T
print(a)
print(b)
print(c)
print(d)

Und die Fehlermeldung ist:

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ValueError                                Traceback (most recent call last)
C:\Users\User\Desktop\praktikum\Daten\CV\test1.py in <module>()
     46 
     47 data = np.genfromtxt(r"C:\Users\User\Desktop\praktikum\Daten\CV\X-CV-58.txt", delimiter = "\t", skip_header = 1) 
---> 48 a,b,c,d = data.T
     49 print(a)
     50 print(b)
ValueError: too many values to unpack (expected 4) 

sind die über 2000 Werte zu viel? Ich dachte Python müsste das packen

[Sirius3]

Dann scheint es doch irgendwo mehr Spalten zu geben, eventuell nur leere.

[__blackjack__]

@Lennart: Du versuchst 6 Spalten auf 4 Namen zu verteilen. Das geht logischerweise nicht.

[ThomasL]

Denn wie man am Header erkennen kann, gibt es rechts noch die Spalten Q+ und Q-, die aber keine Daten enthalten.

[Lennart]

Vielen Dank für die Antworten!
Weil die Spalten leer waren, dachte ich, dass sie nicht als Spalten gezählt werden, weil ich ja skip_header=1 hatte.

Aber jetzt bin ich schlauer

[__blackjack__]

@Lennart: Die Zeilen nach dem Header werden aber ziemlich sicher am Ende noch zwei Spaltentrenner haben, denn auch Felder in denen nichts steht, müssen ja getrennt werden. Wenn der Spaltentrenner ein '\t' ist, dann sieht man das natürlich nicht. Jedenfalls nicht solange man im Editor die Anzeige von „whitespace“-Zeichen nicht einschaltet.