ich schau mir gerade das Package: DendroPy an.
Dazu muss ich sagen, dass ich mich noch gar nicht mit OOP bei Python beschäftigt habe.
http://packages.python.org/DendroPy/tutorial/index.html
Ich habe es auch schon hinbekommen, meinen Baum als Newick-Format einzulesen.
Code: Alles auswählen
import dendropy
t1 = dendropy.Tree.get_from_path('outtree', schema='newick')
Es gibt nun für den Baum mehrere Klassen, auf die man zugreifen kann.
Ich würde sehr gerne den Befehl: get_adjacent_edges benutzen:
http://packages.python.org/DendroPy/lib ... cent_edges
weiß jemand, wie ich den anwenden kann? Ich bekomms einfach nicht hin und wäre für jeden Hinweis dankbar.