Reguläre Ausdrücke

[Dav1d]

jo stimmt, ist mir jetzt auch wieder eingefallen

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a = 'ich bIn ein StrIng'
print a.lower().count('i')

Ergebnis:

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>>> a = 'ich bIn ein StrIng'
>>> print a.lower().count('i')
4
>>> a
'ich bIn ein StrIng'

[mit]

Danke hat funktioniert

[mit]

Wie würde der folgender Perl Code in Python aussehen?

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my ($x1, @model1) = split /\s+/, "AXDA     .255 .245 .245 .255";    
print $x1, "\n";
print @model1, "\n";
my ($x2, @model2) = split /\s+/, "CYEC	  .225 .275 .275 .225";
print $x2, "\n";
print @model2, "\n";

my @lod = map(lg($model1[$_]/$model2[$_]), (0..3));
print @lod, "\n";

my $a = "aagcaaatccgcgataaaattgccttggggcgtataaaagg";
$a =~ tr/acgtACGT/01230123/;
print $a, "\n";
my $score = sum(map($lod[$_], split //,$a));
print $score, "\n"; 

Ausgabe:

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AXDA
.255.245.245.255
CYEC
.225.275.275.225
0.180572245641821-0.166649869409451-0.1666498694094510.180572245641821
00210003112120300003321133222212303000022
1.15346400039175

[Leonidas]

Das ist doch eine neue Frage. Lege dafür doch einen neuen Thread an. Aber es wäre schon schön, wenn du selbst etwas Eigeninitiative zeigst, statt andere den Perl-Code übersetzen zu lassen.

[Defnull]

Richtig. Wir sind hier kein Perl Forum. Probier es selbst und wenn du konkrete Fragen zu Python hast, kannst du die gerne hier stellen.

[mit]

Sorry, habe nun konkrete Fragen:

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#1.
##my ($x1, @model1) = split /\s+/, "AXDA     .255 .245 .245 .255";   
x1, model1 = "AXDA     .255 .245 .245 .255".split()

#2.
##my @lod = map(lg($model1[$_]/$model2[$_]), (0..3));
lod = map(lambda x: [lg($model1[x]/$model2[x] ], range(0,4))

#3
#my $a = "aagcaaatccgcgataaaattgccttggggcgtataaaagg";
#$a =~ tr/acgtACGT/01230123/; 
a = "aagcaaatccgcgataaaattgccttggggcgtataaaagg";
a.translate(string.maketrans('acgtACGT', '01230123')
         
#4.
#my $score = sum(map($lod[$_], split //,$a));

zu 1: Leider erkennt Python nicht, dass model1 ein Array sein soll. Gibt es in Python dafür eine andere schreibweise?

zu 2: Hier bin ich nicht sicher ob es so funktionieren kann, da 1 nicht funktioniert.

zu 3: Das müsste funktionieren.

zu 4: Hier weiss ich nicht wie man es umschreibt.

[Leonidas]

zu 1: Leider erkennt Python nicht, dass model1 ein Array sein soll. Gibt es in Python dafür eine andere schreibweise?

Ab Python 3 geht:

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a, *b = range(3)

zu 2: Hier bin ich nicht sicher ob es so funktionieren kann, da 1 nicht funktioniert.

Ne, kanns nicht weil Python keine Skalar-Dollarzeichen benutzt. Das solltest du inzwischen wissen.

[Defnull]

Zu 1:
x1, model1 = "AXDA .255 .245 .245 .255".split(' ')
model1 = model1.split()

Zu 2: Du solltest für eine bessere Lesbarkeit eine for-schleife nehmen. Map+lambda funktioniert, ist aber eher unleserlich. Und schmeiss die Dollar-Zeichen weg

Zu 4: Was tut es denn? Ich kann kein Perl.

[problembär]

Wie lernt man am besten Reguläre Ausdrücke gibt es ein gutes Buch oder Howtos?

2 Seiten: 1, 2.

Gruß

[cofi]

http://www.regular-expressions.info/

Dort gibt es auch Buecherempfehlungen.

[mit]

Danke, aber leider funktioniert der Code immer noch nicht.

Ich habe hier ( http://www.python-forum.de/viewtopic.ph ... 717#149717 ) ein neues Thema gestartet, da es wirklich nicht mehr hier hinein gehört.

[Ronnie]

Leider weiss ich nicht wie diesen Perl Code:

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$com = 'ADFdiKL'
$com =~ tr/ADFadf/XYZxyz/;

Wie würde dies in Python aussehen?

Zur Not baust du dir eben eine eigene tr-Funktion:

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>>> def translator(source, destination):
	lookup = dict(zip(source, destination))
	return lambda i: ''.join([lookup[c] for c in i])

>>> tr = translator("ADFadf","XYZxyz")
>>> tr('afdFAD')
'xzyZXY'

Allerdings ist es immer empfehlenswert auf erprobte eingebaute Wege zurückzugreifen.

[EyDu]

@Ronnie: http://docs.python.org/library/string.h ... .maketrans.

[Ronnie]

@Ronnie: http://docs.python.org/library/string.h ... .maketrans.

Danke. Die Möglichkeit wurde ja auch schon weiter oben aufgezeigt und es ist immer sinnvoll erprobte eingebaute Funktionen/Methoden zu nutzen. Eigentlich wollte ich nur zeigen, dass es nicht schwer ist die gewünschte Funktion nachzubauen.