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von silky vanilla
Mittwoch 15. August 2007, 14:54
Forum: Allgemeine Fragen
Thema: Leere Zellen mit '0' belegen
Antworten: 9
Zugriffe: 1021

Bei einem print column habe ich festgestellt, dass es mir fuer jede Zeile eine Liste ausgiebt, in der die leeren Zellen nicht mit enthalten sind, also ist die Fehlermeldung berechtigt, da dann natuerlich manchmal weniger Eintraege als 11 enthalten sind. Aber was nun? Wie kann ich jetzt die leeren Ze...
von silky vanilla
Mittwoch 15. August 2007, 13:14
Forum: Allgemeine Fragen
Thema: Leere Zellen mit '0' belegen
Antworten: 9
Zugriffe: 1021

Vielen Dank fuer die Hilfe bisher.

Meine Datei besteht aus 11 Spalten getrennt durch Tabulator. Nun mach ich split('\t') trenne also zeilenweise den String am Tabulator auf. Warum kommt dann trotzdem noch die gleiche Fehlermeldung (list index out of range) an einer Stelle, wo eine leere Zelle ist???
von silky vanilla
Mittwoch 15. August 2007, 09:25
Forum: Allgemeine Fragen
Thema: Leere Zellen mit '0' belegen
Antworten: 9
Zugriffe: 1021

Leere Zellen mit '0' belegen

Hallo an alle, ich moechte gern aus einer Datei (in Form einer Tabelle) die leeren Zellen mit '0' belegen. Folgendes habe ich mir uebrlegt: inp = open('Suppl_Table_1.txt') out = open('Suppl_Table_1_out1.txt','w') for line in inp.readlines(): column = line.split() if column[2] == ' ': column[2] = '0'...
von silky vanilla
Dienstag 17. Juli 2007, 15:23
Forum: Allgemeine Fragen
Thema: noch ein Zaehlerproblem
Antworten: 4
Zugriffe: 398

Ich verstehe nur die Fehlermeldung nicht, es ist nach wie vor die selbe, auch bei dieser Aenderung

Code: Alles auswählen

inp = open('sum_of_all_LLS')

header = inp.readline()
val =0
for line in inp:
    data = line.split()
    
    if int(data[4]) > 1:
        val += 1
print val
inp.close()
von silky vanilla
Dienstag 17. Juli 2007, 14:42
Forum: Allgemeine Fragen
Thema: noch ein Zaehlerproblem
Antworten: 4
Zugriffe: 398

noch ein Zaehlerproblem

inp = open('sum_of_all_LLS') header = inp.readline() for line in inp: data = line.split() data[4] = int(data[4]) val =0 if data[4] > 1: val +=1 print val Ich moechte gern in der 5.Spalte meiner eingelesenen Datei alle die Werte zaehlen, die groesser "1" sind. Es funktioniert jedoch nicht und ich we...
von silky vanilla
Dienstag 17. Juli 2007, 14:38
Forum: Allgemeine Fragen
Thema: Zaehler einbauen
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Zugriffe: 655

Das Problem ist geloest, Danke
von silky vanilla
Dienstag 17. Juli 2007, 13:45
Forum: Allgemeine Fragen
Thema: Zaehler einbauen
Antworten: 7
Zugriffe: 655

@Gerold: Beim Testen kam folgende Fehlermeldung
Traceback (most recent call last):
File "/home/cellnet/claudiak/bei/18.561.296 random interactions/100 50 1000/sum and count evidence.py", line 26, in <module>
val = int(inp_line.split()[3])
IndexError: list index out of range
von silky vanilla
Dienstag 17. Juli 2007, 11:00
Forum: Allgemeine Fragen
Thema: Zaehler einbauen
Antworten: 7
Zugriffe: 655

Nicht schön, also mal lieber Schleifen angucken :wink: Werd ich machen. Zaehlt es aber in deinem Beispiel nicht alle Nullen die vorkommen, also auch die, fall ein Gleitkommazahl in der Spalte steht, die eine Null enthaelt? Ich moechte aber nur wissen aus wieviel Werten, die >0 sind, die Summe beste...
von silky vanilla
Dienstag 17. Juli 2007, 10:31
Forum: Allgemeine Fragen
Thema: Zaehler einbauen
Antworten: 7
Zugriffe: 655

Zaehler einbauen

Ich habe 7 Dateien aus denen ich jeweils die 4.Spalte summiere und in einer neuen Datei, die in der 4.Spalte dann nur noch die Summe enthaelt, ausgebe. inp0 = open('STRING_textmining.tab')header0 = inp0.readline() inp1 = open('Ewing_Score nicht log trans1.LLS') header1 = inp1.readline() inp2 = open(...
von silky vanilla
Freitag 13. Juli 2007, 09:49
Forum: Allgemeine Fragen
Thema: Maximum in Zeile finden
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Zugriffe: 536

oh, danke.

mittlerweile hatte ich es auch schon geloest, sorry also fuer deinen Aufwand. :lol:
von silky vanilla
Freitag 13. Juli 2007, 09:03
Forum: Allgemeine Fragen
Thema: Maximum in Zeile finden
Antworten: 3
Zugriffe: 536

Maximum in Zeile finden

inp0 = open('STRING_textmining.tab') header0 = inp0.readline() inp1 = open('Ewing_Score nicht log trans1.LLS') header1 = inp1.readline() inp2 = open('Rhodes_Score1.LLS') header2 = inp2.readline() inp3 = open('STRING_coexpression1.LLS') header3 = inp3.readline() inp4 = open('STRING_cooccurence1.LLS'...
von silky vanilla
Freitag 13. Juli 2007, 09:03
Forum: Offtopic
Thema: beitrag editieren
Antworten: 2
Zugriffe: 551

beitrag editieren

ich habe versehentlich beim Erstellen eines Beitrages zweimal auf absenden geklickt, nun wollte ich den kompletten Beitrag loeschen, aber irgendwie scheint das nicht zu gehen.

Oder weiss jemand wie
von silky vanilla
Donnerstag 12. Juli 2007, 14:06
Forum: Allgemeine Fragen
Thema: matplotlib vs gnuplot
Antworten: 4
Zugriffe: 908

Oh ja, natuerlich... linux
von silky vanilla
Donnerstag 12. Juli 2007, 12:10
Forum: Allgemeine Fragen
Thema: matplotlib vs gnuplot
Antworten: 4
Zugriffe: 908

matplotlib vs gnuplot

Ich habe zwei Dateien. Nun moechte ich eine Spalte einer Datei als x-Werte einlesen und eine Spalte der anderen Datei als y-Werte einlesen. Das ganze moechte ich dann grafisch abbilden. Ich habe beides, sowohl matplotlib als auch gnuplot heruntergeladen. Doch hab ich nun noch Probleme mit der Instal...
von silky vanilla
Mittwoch 11. Juli 2007, 16:33
Forum: Allgemeine Fragen
Thema: Zwei Dateien zu einer machen
Antworten: 15
Zugriffe: 5894

hatte das schon so verstanden wie es gemeint war, danke

aber hat denn niemnd ein Antwort auf meine letzte Frage?