Ich hatte dieses Problem mit filedialog.askdirctory() und dem Backslash auch. Die Lösung ist aber eigentlich ganz einfach:

>>> from tkinter import filedialog
>>> system_pfad = filedialog.askdirectory(title = "Ordner wählen")
>>> print(system_pfad)
C:/Windows/System
>>> pfad_neu = system_pfad ...