Danke für eure Antworten!

Der Befehl
funzt wunderbar

Hi,

ich nutze für alle meine Programme/Scripte einen Programmkopf um mich im nachhinein besser zurecht zu finden.

Der Header sieht wie folgt aus:

def header():
import sys
import datetime
import time

scriptname = sys.argv[0]
sys.stderr.write ("## %s\n" % scriptname)
print "##"
print ...

habe den Fehler gefunden:

es lag an dem SELECT statement:


sql = "SELECT * FROM table WHERE entry = '%s'"
for temp in TEST:
cursor.execute(sql % temp)


fragt mich nicht wie ich auf VALUES kam :) ...hat mich ewig gekostet den Fehler zu finden. Vielleicht habe ich es einfach in der Literatur bei ...

Hi,

mein Problem sieht wie folgt aus:

Ich will aus meiner Datenbank/Tabelle bestimmte Informationen lesen. Nach dem ich die Verbindung zur Datenbank hergestellt habe lese ich das SELECT statement in die Variable 'sql' ein:

sql = "SELECT * FROM tabel WHERE entry = 'test'"
cursor.execute(sql ...

Hi, habe deine nachricht eben erst gelesen.

ich habe es die besagte zeile bearbeitet

vielen Dank für eure Hilfe!!

Hallo ihr da draußen!

Meine kleine Vorgeschichte, ich komme aus der Bioinformatik und arbeite daher intensiv mit Datenbanken und Scripten. Die ganze Zeit nutzte ich Perl um meine Ideen umzusetzen, doch um mich nicht ganz in Perl fest zu beißen erlerne ich nebenbei Python.

Falls ihr Zeit habt, dann ...

Danke Rebecca,

du hast mir mit diesem winzigen Befehl das Leben sehr erleichtert!

Hi,

ich habe in sämtliche mir bekannten Python-Quellen nach einem Befehl durchsucht, der in einem Quellcode untergebracht werden kann und das laufende Script, an der Stelle wo er aufgerufen wird, abbrechen lässt.

Toller Satz :)

Beispiel:

verbinde dich zu datenbank
if verbindung == 'true':
mach ...

danke für deinen Tipp,

dann werde ich mir noch mal das Kaptile zu den Mehtoden und Dictionary durchlesen und ich bin gespannt, ob ich damit besser fahre.


vielen Dank für eure Hilfe und Geduld!

nein, ich will nicht nur einfach die doppelten Einträge eliminieren (da hätte ich in der Tat distinct genügt). Ich hätte gerne für spätere Anwendungen im Script einen mehrdimensionales Dictionary auf das ich jeder Zeit mit Keys zugreifen kann.

Wie müsste ich denn den Synthax definieren um ein ...

jetzt tritt bei mir leider ein neues Problem auf.

folgende Daten werde durch mein Select Statement aus meiner DB geliefert:

geneA - promoter1 - forward - plus
geneA - promtoer2 - forward - plus
geneA - promoter3 - reverse - plus

geneB - promoter1 - reverse - minus
geneB - promoter1 - reverse ...

perfekt!!

Genau das habe ich gesucht!


Danke

hmm ich muss euch erneut belässtigen :)

wenn ich mein Dic folgendermaßen umsetze:

GENE_PROMOTER_DIRECTION_STRAND = {gene:{promoter:{direction:strand}}}

gene, promoter, direction und strand sind Variablen die ich aus meine Datenbank lese

for gene, promoter, direction, strand in cursor.fetchall ...

huhu danke!!

und ich habe gehofft, dass Python die 'doppelten' Dictionaries überschreibt. War mir auch fast sicher, aber man kann nie wissen

nochmals Danke!!

Hi zusammen!

Ich bin ein Neuling in Thema Python und bräuchte eure Hilfe in Sachen mehrdimensionale Dictionary.

Mit Perl bin ich groß geworden, doch jetzt will ich auch in die Python Programmierung einsteigen. Doch zu Anfangs tut man da sich wie überall schwer.

Meine Frage an euch lautet. Wie ...

Hi aquila!

Das mit dem Mehrfachpost war keine Absicht, der Proxy hat mal wieder gesponnen und so habe ich die Form zweimal submittet :( Sorry

Deine Antwort hat mich sehr gefreut und es hat einen kleinen Moment gedauert bis ich durchgestiegen bin. Hehe was soll ich sagen bin ein 'native perler' der ...

Hi,

ich bin ein Neuling was Python angeht und habe eine Frage.

Ich habe ein HTML Document aus dem ich verschiedene Links auslesen möchte. Ein kleiner Auszug:


</TR>
<tr><th align=left>HRG</th>
<td><A href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&term=liver+AND+HRG" TARGET ...