Hallo Leute,

ich möchte mit meinem Skript Text-Dateien öffnen und spezifische Positionen im String verändern.
Hierbei haben ich zwei Files, die ich mit meinem Skript aufrufe.

Die 1. File hat folgenden Inhalt: AAAAAAAAAACCCCCCA
und die 2. File hat folgenden Inhalt: AAAAAAAAATTTTACAC

Hier der Code ...

Der untere Teil beginnt ab # run findtemplatedb python script (Kmer Finder 2.0).

Einen Fehler konnte ich entdecken und habe ihn korrigiert (kleiner Fehler im Pfad !)

Wenn ich den unteren Teil auskommentiere funktioniert das Skript einwandfrei. D.h. ich bekomme keine Fehlermeldung
und das Skript ...

Hi Leute,

ich habe folgende Bitte. Der obere Teil klappt einwandfrei (run maketemplatedb script). Im unteren Teil bekomme ich folgende Fehlermeldung (s. unter dem Code).
Ich bin mir nicht sicher wie ich das lösen kann. Hat einer von euch eine Idee ?



#!~/Desktop/Python-2.7
# coding: utf8

import ...

Hallo Leute,

ich habe folgendes Problem:

Ich möchte erreichen, das Folgendes in der Konsole eingelesen bzw. ausgegeben wird.

./bwa index -a 'is' /path/to/folder/datei.fa

Bisher schaffe ich es noch nicht die Datei direkt an den Pfad zu hängen. Habt ihr eine Idee wie man das mit Python schafft ...

Hi Leute,

danke für eure Hilfe. Ich bin noch recht neu in der Pythonprogrammierung.

Es lag daran, dass ich die Zeile nicht eingerückt habe. Es schadet nicht das zu tun


Vielen Dank !


VG Flo

Hallo Leute,

ich habe folgende Frage:

Ich möchte hiermit eine Seite aufrufen.

import subprocess

subprocess.call(["firefox", "-new-tab","https://cge.cbs.dtu.dk/services/CGEpipeline-1.1/"])
^
IndentationError: expected an indented block

und bekomme dann diese Fehlermeldung heraus. Wie kann man ...

Ja, da hast du recht. Das geht leider nicht.

Wenn ich das Programm starte öffnet sich Cygwin in seiner eigenen Shell.

Hi,

danke für deine Antwort.
Ich hab das manuell probiert mit Cygwin.

Hallo Leute,

ich bin neu hier im Forum und habe folgendes Problem:
Das hier ist mein Code.

from subprocess import *

# Links to Tools
open_mafft = "C:/Users/Public/Desktop/Cygwin64 Terminal.lnk"


# Opens up the Tool
p = Popen([open_mafft,"mafft C:/Users/Florian/Desktop/ortholog_group ...