Danke für die schnelle Antwort.
Ich habe mein Skript zunächst etwas bearbeitet:

#!/usr/bin/env python
# -*- coding: utf-8 -*-

# Datei zeilenweise parsen
daten_in = open("x03", "r")
daten_out = open("part_3.mol2", "w")

for index, zeile in enumerate(daten_in):
liste = zeile.split()
part_typ ...

Hallo,

ich studiere Physik und versuche zur Zeit eine relativ große Menge an Messdaten zu formatieren.
Hier zunächst erstmal mein Skript:

#!/usr/bin/env python
# -*- coding: utf-8 -*-

# Datei zeilenweise parsen
daten_in = open("x02", "r")
daten_out = open("part_2.mol2", "w")

i = 0
for zeile in ...