Anweisung: ('countBlackJack', {'vcfFile': '2011_08_19_Testrun_01-1-Idx_11-7.bam/2011_08_19_Testrun_01-1-Idx_11-7.bam.small.vcf'})
Programm beendet in 0.0160757025083 min.
Anweisung: ('countNork', {'vcfFile': '2011_08_19_Testrun_01-1-Idx_11-7.bam/2011_08_19_Testrun_01-1-Idx_11-7.bam.small.vcf ...

@nork: Du bist mit Informationen ein wenig geizig. Die Gesamtgrösse der Datei und eine genauere

Also die Größe beträgt 9,2 GB (9889235283 Bytes). Die Größe mag aber potentiel eher größer sein.

Zeitangabe als „ewig” wären Beispielsweise nützlich das mal auf konkrete Zahlen von Zeilen und Bytes ...

Moin,

danke sma für eine erste Analyse. Bei der Variablennamen vergabe hab ich sicher noch nachhol Potential, aber sein altes Schema raus zu bekommen ist nicht so einfach. Wobei ich gerne den Datentyp vor eine Variable setzte um zu wissen was da eigentlich drin sein soll.

Ich hatte über ...

Moin @ll,

ich habe gerade mit der Python Programmierung angefangen und habe gleich ein Performance Problem.

Ich habe eine riesige Datei mit mehr als 18.526.903 Zeilen. Nun möchte ich diese Datei aufschlüsseln und auszählen.
In dieser Datei sind Basen, Chromosomnamen und die Coverage der Base ...