Autocomplete ist mir viel zu schwach in PyDev.
Debug Unterstützung nicht ausreichend.
PIP package Unterstützung, über Konsole unerwünscht.
Django Unterstützung nicht ausreichend.
Django Template Unterstützung mit auto complete in PyCharm.
On-the-fly error highlighting und handling.
Überaus gute code analyse in PyCharm.
Sehr gute Test-Integrierung.
Javascript debugger.
Die Anzahl unterstützter Frameworks ist höher (z.B. Django, Flask, Google App Engine, Pyramid, web2py, etc.).
Remote Entwicklung möglich.
Sehr gute Source Code Verwaltung.
In dem Sinne hat es einfach in vielen Punkten schlicht einzig mehr Features, wenn man so möchte.
http://www.jetbrains.com/pycharm/
Leider muss ich jedoch gestehen das ich mir PyDev zuletzt Anfang des Jahres angeschaut habe. Von daher erscheint es mir als unangebracht auf einzelne Punkte näher ein zu gehen. Dies wäre nicht fair gegenüber PyDev. Doch was ich gesehen habe hatte mich nicht überzeugt in folgenden Punkten: Django Unterstützung und die virtualenv und pip Unterstützung. Hier wird man sehr verwöhnt von PyCharm, alles über klick möglich in PyCharm. Pip package updates werden z.B. angezeigt und können via Knopf upgedatet werden. Flask welches ich neben Django auch recht gern nutze, wird auch prächtig unterstützt von Jinja bis hin zu SQLAlchemy und mongoDB.
Rein geschmacklich und unterbewusst hinterließ PyDEV bei mir oft einfach den Eindruck noch nicht fertig zu sein. Weswegen ich es halt aber auch nicht außer acht lasse. An Stabilität und auch Konfiguration (PyDEV muss noch reichlich konfiguriert werden, bevor man los legen kann) ins besondere der Features/Unterstützender "Bereich" Frameworks von PyCharm, kommt das schon Visual Studio oder xCode gleich, zumindest jedoch ungeheuerlich nahe!
Und wenn ich es mit Visual Studio 2013 und nuget vergleiche, dann ist PyCharm was packages anbelangt um längen besser.
Du schriebst noch, weil du noch andere Sprachen einsetzt: Java, C++, Fortran, PHP (setze ich nicht ein).
HTML, CSS, Javascript, Coffescript, AngularJS. Werden sehr gut unterstützt.
Bezüglich Java und PHP, die Leute hinter PyCharm besitzen die einzige erfolgreiche kommerzielle IDE für Java, welche eclipse überlebt hat und auch in vielen mir bekannten Firmen mehr anklang findet. Für PHP gibt es PhpStorm, soll auch seht gut sein. Im .NET Umfeld sind sie Ruhmreich mit dem ReSharper und .dll dekompieler unterwegs und noch vieles mehr.
In der Hoffnung nicht zu viel blub...